《医学方-科研系列课程》百度云网盘下载[10.24GB]

《医学方-科研系列课程》百度云网盘下载[10.24GB]-米时光

医学方精品课程—从数据挖掘–MIMIC–R语言基础–R语言作图–R语言高级医学统计–基因编辑–医学统计学,应有尽有。

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├─医学方-科研系列课程

│ ├─01-GEO、TCGA、Oncomine数据挖掘教程

│ │ │ 课时1 数据挖掘概述.mp4

│ │ │ 课时10 TCGA数据整理和基因注释.avi

│ │ │ 课时11 寻找差异基因和制作5年生存率.avi

│ │ │ 课时12 Oncomine概述及Meta分析.avi

│ │ │ 课时13 Oncomine之差异分析及共表达分析.avi

│ │ │ 课时14 非cel格式GEO芯片数据分析.mp4

│ │ │ 课时2 GEO在线工具的应用.avi

│ │ │ 课时3 GEO数据下载和数据质量分析.avi

│ │ │ 课时4 原始数据预处理.avi

│ │ │ 课时5 寻找差异基因及制作热图和火山图.avi

│ │ │ 课时6 富集分析.avi

│ │ │ 课时7 KEGG分析.avi

│ │ │ 课时8 蛋白互作网络.avi

│ │ │ 课时9 TCGA数据下载.avi

│ │ │

│ │ └─数据挖掘代码

│ │ └─代码

│ │ │ GEO.txt

│ │ │ TCGA.txt

│ │ │

│ │ ├─perl

│ │ │ ensemblToSymbol.pl

│ │ │ mRNA_merge.pl

│ │ │ putFilesToOneDir.pl

│ │ │ survival_time.pl

│ │ │

│ │ └─资料(脚本及源码)

│ │ │ GEO.txt

│ │ │ GEO中非cel文件脚本.txt

│ │ │ TCGA.txt

│ │ │

│ │ └─perl

│ │ ensemblToSymbol.pl

│ │ gb2symbol.pl

│ │ mRNA_merge.pl

│ │ probe2symbol.pl

│ │ putFilesToOneDir.pl

│ │ survival_time.pl

│ │

│ ├─02-MIMIC临床数据使用入门

│ │ MIMIC临床数据库使用入门 – 课时1-3.mp4

│ │ MIMIC临床数据库使用入门 – 课时4-5.mp4

│ │ SQL QUERY.docx

│ │

│ ├─03 R语言可视化及绘图

│ │ 10、10.几何对象之点图.mp4

│ │ 11、11.几何对象之条图.mp4

│ │ 12、12.几何对象之盒形图和直方图.mp4

│ │ 13、13.几何对象之线图.mp4

│ │ 14、14.几何对象之标签绘制.mp4

│ │ 15、15.坐标轴自定义函数.mp4

│ │ 16、16.图例与标题.mp4

│ │ 17、17.坐标系转换函数与图片分面函数.mp4

│ │ 18、18.主题函数&一页多图&高质量图片导出.mp4

│ │ 19、19.venn图和火山图.mp4

│ │ 1、1.par函数.mp4

│ │ 20、20.nomogram和heatmap.mp4

│ │ 21、21.生存曲线.mp4

│ │ 2、2.散点图&盒形图.mp4

│ │ 3、3.条形图&直方图.mp4

│ │ 4、4.饼图&克利夫兰点图&条件图.mp4

│ │ 5、5.低级绘图函数(1).mp4

│ │ 6、6.低级绘图函数(2).mp4

│ │ 7、7.图形颜色选取.mp4

│ │ 8、8.ggplot2之qplot.mp4

│ │ 9、9.ggplot2之美学函数.mp4

│ │ 医学方R语言可视化配套代码.pdf

│ │

│ ├─04-R语言与高级医学统计学

│ │ 1.mp4

│ │ 10.mp4

│ │ 11.mp4

│ │ 12.mp4

│ │ 13.mp4

│ │ 14.mp4

│ │ 15.mp4

│ │ 16.mp4

│ │ 17.mp4

│ │ 18.mp4

│ │ 19.mp4

│ │ 2.mp4

│ │ 20.mp4

│ │ 21.mp4

│ │ 22.mp4

│ │ 23.mp4

│ │ 24.mp4

│ │ 25.mp4

│ │ 26.mp4

│ │ 27.mp4

│ │ 28.mp4

│ │ 29.mp4

│ │ 3.mp4

│ │ 30.mp4

│ │ 31.mp4

│ │ 32.mp4

│ │ 33.mp4

│ │ 4.mp4

│ │ 5.mp4

│ │ 6.mp4

│ │ 7.mp4

│ │ 8.mp4

│ │ 9.mp4

│ │

│ ├─05-豪斯医生数据挖掘之WGCNA详解

│ │ ClinicalTraits.txt

│ │ epr.txt

│ │ 医学方豪斯医生WGCNA配套代码.pdf

│ │ 课时01.使用cytoscape寻找核心基因.MP4

│ │ 课时02.WGCNA理论和算法1.mp4

│ │ 课时03.WGCNA理论和算法2.mp4

│ │ 课时04.WGCNA理论和算法3.mp4

│ │ 课时05.WGCNA理论和算法4.mp4

│ │ 课时06.输入文件准备.mp4

│ │ 课时07.寻找基因模块.mp4

│ │ 课时08.与临床信息相结合.mp4

│ │ 课时09.确定核心基因.mp4

│ │

│ ├─06-数据挖掘—miRNA调节网络的构建

│ │ ├─01、TCGA概述

│ │ │ 01、TCGA概述.mp4

│ │ │ 02、TCGA概述.mp4

│ │ │ 03、TCGA概述.mp4

│ │ │

│ │ ├─02、构建调控关系理论

│ │ │ 01、构建调控关系理论.mp4

│ │ │ 02、构建调控关系理论.mp4

│ │ │ 03、构建调控关系理论.mp4

│ │ │

│ │ ├─03、WGCNA理论

│ │ │ 01、WGCNA理论.mp4

│ │ │ 02、WGCNA理论.mp4

│ │ │ 03、WGCNA理论.mp4

│ │ │ 04、WGCNA理论.mp4

│ │ │

│ │ ├─04、数据下载

│ │ │ 01、数据下载.mp4

│ │ │ 02、数据下载.mp4

│ │ │ 03、数据下载.mp4

│ │ │ 04、数据下载.mp4

│ │ │

│ │ ├─05、提取蛋白编码基因

│ │ │ 01、提取蛋白编码基因.mp4

│ │ │ 02、提取蛋白编码基因.mp4

│ │ │ 03、提取蛋白编码基因.mp4

│ │ │ 04、提取蛋白编码基因.mp4

│ │ │ 05、提取蛋白编码基因.mp4

│ │ │

│ │ ├─06、差异分析

│ │ │ 01、差异分析.mp4

│ │ │ 02、差异分析.mp4

│ │ │ 03、差异分析.mp4

│ │ │

│ │ ├─07、基于算法构建调控

│ │ │ 01、基于算法构建调控.mp4

│ │ │ 02、基于算法构建调控.mp4

│ │ │ 03、基于算法构建调控.mp4

│ │ │ 04、基于算法构建调控.mp4

│ │ │

│ │ ├─08、cytoscape构建网络

│ │ │ 01、cytoscape构建网络.mp4

│ │ │ 02、cytoscape构建网络.mp4

│ │ │

│ │ ├─09、数据库预测

│ │ │ 01、数据库预测.mp4

│ │ │ 02、数据库预测.mp4

│ │ │ 03、数据库预测.mp4

│ │ │ 04、数据库预测.mp4

│ │ │

│ │ └─医学方miRNA调节网络的构建配套代码

│ │ │ TCGA.txt

│ │ │

│ │ ├─DEmiRNA

│ │ │ diffmiRNAExp.txt

│ │ │

│ │ ├─DEmRNA

│ │ │ diffmRNAExp.txt

│ │ │

│ │ ├─merge

│ │ │ .Rhistory

│ │ │ diffmiRNAExp.txt

│ │ │ diffmRNAExp.txt

│ │ │ edge.txt

│ │ │ node.txt

│ │ │ rmiRNA.txt

│ │ │ rmRNA.txt

│ │ │

│ │ ├─miRNA

│ │ │ │ metadata.cart.2018-01-17T14_59_36.956035.json

│ │ │ │ miRNAmatrix.txt

│ │ │ │ miRNA_merge.pl

│ │ │ │

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│ │ │ │

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│ │ │ │

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│ ├─07.医学方医学数据挖掘精品课程-手把手教您如何数据挖掘

│ │ 10.TCGA数据整理和基因注释.mp4

│ │ 11.寻找差异基因和制作5年生存率.mp4

│ │ 12.Oncomine概述及Meta分析.mp4

│ │ 13.Oncomine之差异分析及共表达分析.mp4

│ │ 1数据挖掘概述.mp4

│ │ 2.GEO在线工具的应用.mp4

│ │ 3.GEO数据下载和数据质量分析.mp4

│ │ 4.原始数据预处理.mp4

│ │ 5.寻找差异基因及制作热图和火山图.mp4

│ │ 6.GO富集分析.mp4

│ │ 7.KEGG分析(修复).mp4

│ │ 8.蛋白互作网络.mp4

│ │ 9.TCGA数据下载.mp4

│ │ 课程脚本代码.zip

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│ └─08-医学R语言快速入门与数据清洗

│ 01.R语言、Rstudio简介.avi

│ 02.R包的安装&向量.avi

│ 03.数值型&逻辑型向量.avi

│ 04.逻辑表达式&字符串向量.avi

│ 05.因子型变量.avi

│ 06.列表&矩阵.avi

│ 07.数组&初识数据框.avi

│ 08.数据框.avi

│ 09.数据框的基本操作.avi

│ 10.条件与循环.avi

│ 11.自定义函数&数据读取.avi

│ 12.数据的读取与写出.avi

│ 13.数据排序与长宽型数据转换.avi

│ 14.变量的因子化.avi

│ 15.apply函数家族.avi

│ 16.数据汇总函数.avi

│ 17.plyr包.avi

│ 18.dplyr包.avi

│ 19.data.table包.avi

│ 20.缺失值的识别与处理(1).avi

│ 21.缺失值的识别与处理(2).avi

│ 22.异常值和重复值的处理.avi

│ 23.字符串的处理.avi

│ 24.正则表达式.avi

│ 25.stringr & stringi包.avi

│ 26.时间与日期数据的处理.avi

│ 27.lubridate包.avi

│ 28.时间序列简介.avi

│ 29.时间序列分析.avi

│ 30.描述性统计.avi

│ 31.t检验.avi

│ 32.数据变换.avi

│ 33.方差分析.avi

│ 34.卡方检验.avi

│ 35.回归分析与模型诊断.avi

│ 36.模型诊断与Logistic回归.avi

│ 37.生存分析与COX回归.avi

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